Nacida en 1960, es natural de Esplús (Huesca) y tiene una hija.
Fue elegida concejala del Ayuntamiento de Esplús (Huesca) en las elecciones municipales de 1983, cargo que desempeña hasta 1999 en que es elegida edil encargada del área de Educación y Cultura en el Ayuntamiento de Huesca.
En la Diputación Provincial de Huesca, Eva Almunia se encargó del área de Cultura y Educación entre 1987 y 1995.
Tras las elecciones municipales de 1999, se hace cargo del área de Iniciativas Locales de la Delegación Provincial de Huesca. Eva Almunia ha sido también portavoz adjunto de esta institución.

Desde julio de 2001 está al frente de la Consejería de Educación y Ciencia del Gobierno de Aragón